Научно-исследовательский институт фундаментальных и прикладных исследований был создан в 2002 году и является важной частью Одесского национального морского университета. Он объединяет все исследовательские лаборатории ОНМУ.

За первые 10 лет своего существования было проведено более 1000 научно-исследовательских проектов, значительная часть которых была опубликована в виде монографий, научных статей и была введена в производство.

Многое было сделано по контрактам с министерством военно-морского флота, судоходными компаниями, портами и верфями.

За годы существования исследовательского сектора постоянно расширялся спектр направлений, количество и объемы научных исследований.

Одним из основных направлений исследований является портовая инженерия.